従来のフラット35（買取型）は、住宅金融支援機構が金融機関から住宅ローン債権を買い取り、証券化するという仕組みでした。それに対し、フラット35（保証型）は、住宅ローンの返済を金融機関に対して住宅金融支援機構が保証する仕組みで、金融機関が自ら住宅ローン債権を証券化できるようになりました。その結果金融機関が独自の商品内容を設定できる余地が発生したのです。
そこで、フラット35を借り換え可能とする金融機関が登場。今までは金利が違うということ以外に金融機関ごとの商品内容に違いがありませんでしたが、今後はフラット35の中でも様々なバリエーションをもった商品の提供が期待できます。
フラット35（保証型）なら、通常の住宅ローンの借り入れ・借り換えの際に支払う保証料（例：2,500万円を35年返済で借りる場合→約50万円）が必要ありません。ただでさえかさむ借り換え時の諸費用を抑えることができます。